Шар води, що цвіте, може досягати 10-15 см завтовшки. Водночас виникає придуха риби й вона гине. Тому найефективніший засіб боротьби з цвітінням — збирання мікроскопічних організмів спеціальними катерами. Зібрану масу використовують як добриво, для виготовлення паперу, картону, лаків та фарб.

Фактори, що призводять до цвітіння:
- підвищення температури води: залежить від глобальної зміни клімату;
- уповільнення течії води у руслі Дніпра: перші водосховища побудували на Дніпрі ще в 20-х роках минулого століття, перетворення стрімкої ріки на каскад водосховищ призвело до екологічних наслідків;
- надлишок стічних вод міст, промислових та аграрних підприємств, які містять сполуки нітрогену, фосфору, заліза, кремнію та органічних речовин;
- використання в сільськогосподарському виробництві мінеральних та органічних добрив, пральних засобів сприяє забрудненню фосфором.
Є випадки грубого порушення природоохоронного законодавства: стічні води несанкціоновано без очищення скидають у Дніпро чи його притоки. Існує й інша проблема нітратного забруднення ґрунтових вод. Причиною є недбала сільськогосподарська діяльність, що призводить до отруєння людей, які п’ють воду з криниць.
Як позбутися цвітіння?
Першопричина розвитку водоростей та цвітіння води — застій. Щоб запобігти цьому процесу потрібно забезпечити невпинний рух у воді. Це реально, якщо вмонтувати у водойму фонтан або спеціальний насос. Таке обладнання призведе в рух воду та постачатиме кисень.
Для ефективної очистки стічні води мають проходити три етапи очищення. Провідний метод – біологічне очищення стічних вод, що сягає 30-40% і очищає водойму від сполук нітрогену. Метод очищення від фосфору – реагентний – є типовим для очисних споруд країн Європи, але відсутній в Україні.
Не менш ефективним засобом у боротьбі з цвітінням є спеціальні біопрепарати для очищення водойм. Їх склад розроблений на ліквідування водоростей та не шкодить екосистемі водойми.
Ще один спосіб — застосування установки УФ-стерилізатора. Цей пристрій фільтрує воду та знезаражує її завдяки УФ-лампі й руху води. Такий прилад ефективно усуває цвітіння водойми.